xylose isomerase
|
class : alpha beta barrel |
number of structures : 6 |
average size : 388 |
average PID : 69
% |
PDB
code |
start
residue |
start
chain |
end
residue |
end
chain |
name |
source |
resolution |
R-factor |
1dxi
 |
1 |
A |
388 |
A |
xylose isomerase |
Streptomyces murinus |
2.60 |
21.40 |
1xya
 |
1 |
A |
386 |
A |
xylose isomerase |
Streptomyces olivochromogenes |
1.81 |
16.10 |
6xia
 |
1 |
- |
387 |
- |
xylose isomerase |
Streptomyces albus |
1.60 |
14.10 |
1xim
 |
3 |
A |
394 |
A |
xylose isomerase |
Actinoplanes missouriensis |
2.20 |
15.20 |
4xia
 |
2 |
A |
394 |
A |
xylose isomerase |
Arthrobacter, strain B3728 |
2.30 |
15.60 |
1bxb
 |
1 |
A |
387 |
A |
xylose isomerase |
Thermus aquaticus |
2.2 |
17.97 |
|
pir |
ali |
malform |
joy-html |
colour postscript |
postscript |
superimposed coordinates
(RasMol)
|
10 20 30 40 50
1dxia ( 1 ) msfqptpedrFTFGLwTVgwqGrdpfgdatRpaldpveTVqrLaelgAyG
1xyaa ( 1 ) syqptpedrFTFGLwTVgwqGrdpfgdatRpaldpveTVqrLaelgAhG
6xia ( 1 ) nyqptpedrFTFGLwTVgweGrdpfgdatRtaLdpveSVrrLaelgAhG
1xima ( 3 ) vqAtredkFSFGLwTVgwqArdafgdatRtaLdpveAVhkLaeigAyG
4xiaa ( 2 ) vqptpadhFTFGLwTVgwtGadpfgvatRanLdpveAVhkLaelgAyG
1bxba ( 1 ) myepkpehrFTFGLwTVgnvgrdpfgdavrerldpvyVVhkLaeLgAyG
333 bbbbaaaa aaaaaaaaaaa b
60 70 80 90 100
1dxia ( 51 ) VTFhdddLipfgSsdtereshikrFrqAldatgMtVpMAtTnlfthpvFk
1xyaa ( 50 ) VTFhdddLipfgssdtereshikrFrqaldatgMtVpMATTnlfthpvFk
6xia ( 50 ) VTFhdddLIpfgssdseryehvkrFrqAlddtgMkVPMATTnlfthpvFk
1xima ( 51 ) ITFHdddLvpfgsdaqtrdgiiagFkkAldetgLiVpMVTTnlfthpvFk
4xiaa ( 50 ) ITFhdndLipfdAtaaerekilgdFnqAladtgLkVPMVTTnlfshpvFk
1bxba ( 50 ) VNLhdedLiprgtppaerdqiVrrFkkAldetgLkVPMVtAnlfsdpaFk
bbbbaaaa aaaaaaaaaaaaaaaaaa bbb 333
110 120 130 140 150
1dxia ( 101 ) dGGfTAndrdvrryAlrkTigNIdLAaeLgAkTYVawgGrEGaesggakd
1xyaa ( 100 ) dGGFTAndrdvrryAlrkTirNIdLAveLgAkTYVawgGrEGaesgaaKd
6xia ( 100 ) dGGFTAndrdvrryAlrkTirNIdLAveLgAeTYVawgGrEGaesggaKd
1xima ( 101 ) dGGFTSndrsvrryAirkVlrQMdLGaeLgAktLVlWgGrEGaeydsaKd
4xiaa ( 100 ) dGGFTSndrsirrfAlakVlhNIdLAaeMgAeTFVmwgGrEGseydgsKd
1bxba ( 100 ) dGAFTSpdpwvrayAlrKSleTMdLGaeLgAeIYVvwpGrEGaeveatgk
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa bbbb bb
160 170 180 190 200
1dxia ( 151 ) vrdaldrmkeAFdlLGeyVtaqgydLrFAIEPKpneprgdIllptVghAl
1xyaa ( 150 ) vrvAldrMkeAFdlLGeyVtsqgydTrFAIePKpneprgdIllptVghAl
6xia ( 150 ) vrdAldrMkeAFdlLGeyVtsqgydIrFAIePKpneprgdIllptVghAl
1xima ( 151 ) vsaAldrYreALnlLAqySedrgygLrFAIEPKpneprgdIllptAghAI
4xiaa ( 150 ) laaaldrmregVdtAAgyIkdkgynLrIALEPKpneprgdIflptVghGl
1bxba ( 150 ) arkVwdwvreaLnfMAayAedqgygYrFALePKpnepRgdIyFatVgsMl
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa bbbb bb aaaaa
210 220 230 240 250
1dxia ( 201 ) afIerLerpelYGVNPEvGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLFHIDLNGQs
1xyaa ( 200 ) afIerLerpelYGVNPEVGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLfHIDLNGQs
6xia ( 200 ) afIerLerpelYGVNPEvGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLfHIDLNGQn
1xima ( 201 ) afVqeLerpeLFGINPEtGHEqMsnlnFtqgIaqAlwhkkLfHIDLNGQh
4xiaa ( 200 ) afIeqLehgdiVGLNPEtGHEqMaglnFthgIaqALwaekLFHIDLNGQr
1bxba ( 200 ) aFIhtLdrperFGLNPEFAHETMaglnFvhaVaqAldagkLfHIDLNDQr
aaa 333bbb aaaaa aaaaaaaaaa bb
260 270 280 290 300
1dxia ( 251 ) gikydqDlrFGaGdlraaFwLVdlLeta------gyegPrHFdFkPprte
1xyaa ( 250 ) gikyDqDlrFGaGdlraAFwLVdlLesa------gyegprHFDFkPprte
6xia ( 250 ) gikydqdlrFGaGdlraaFwLVdlLesa------gysgPrHFdFkPprte
1xima ( 251 ) gpkfdqDlvFGhGdllnaFsLVdlLEnG-pdgapaYdgpRHFDYkPsrte
4xiaa ( 250 ) gikydqdlvFGhGdltsAFfTVDLLenGfpnggpkYtgPrHFdYkPsrtd
1bxba ( 250 ) msrfdqdlrFGsenlkaAFfLVdlLess------gyqgPRHFdAhAlrte
aaaaaaaaaaaaa bbb
310 320 330 340 350
1dxia ( 295 ) dfdgVWasAagCMrnYlilkdrAaaFradpeVqealraAr--ldqlaqpt
1xyaa ( 294 ) didgVWasAagCMrnYliLkerAaaFradpeVqealraSr--ldelaqpt
6xia ( 294 ) dfdgVwasAagCMrnYliLkerAaaFradpeVqeAlraSr--ldelarpt
1xima ( 300 ) dydgVwesAkaNirmYLlLkerAkafradpeVqeAlaaSk--vaelktpt
4xiaa ( 300 ) gydgVwdsAkaNMsmYllLkerAlaFradpeVqeaMktSg--vfelgett
1bxba ( 294 ) deegVWaFArgCMrtYliLkerAeaFredpeVkellaayyqedpaal--a
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa aaaaaaaaa
360 370 380 390
1dxia ( 343 ) aad--gldalladraafedfdvdaaaargmafehldqLAmdhllgarg
1xyaa ( 342 ) aad--gvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlAmdHllgar
6xia ( 342 ) aad--glqallddrsafeefdvdaaaargmaferldqlAmdhLlgarg
1xima ( 348 ) lnpgegyaelladrsafedydadavgakgfgfvklnqlaieHLlgar
4xiaa ( 348 ) lnagesaadlmndsasfagfdaeaaaernfafirlnqLAieHLlgsr
1bxba ( 342 ) llgpysrekaealkra--elpleakrrrgyalerldqlAveYllgvrg
aaaa aaaaa aaaaaaaaaaaa