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xylose isomerase

class : alpha beta barrel number of structures : 6 average size : 388 average PID : 69 %

PDB
code
start
residue
start
chain
end
residue
end
chain
name source resolution R-factor
1dxi rasmol 1 A 388 A xylose isomerase Streptomyces murinus 2.60 21.40
1xya rasmol 1 A 386 A xylose isomerase Streptomyces olivochromogenes 1.81 16.10
6xia rasmol 1 - 387 - xylose isomerase Streptomyces albus 1.60 14.10
1xim rasmol 3 A 394 A xylose isomerase Actinoplanes missouriensis 2.20 15.20
4xia rasmol 2 A 394 A xylose isomerase Arthrobacter, strain B3728 2.30 15.60
1bxb rasmol 1 A 387 A xylose isomerase Thermus aquaticus 2.2 17.97
pir | ali | malform | joy-html | colour postscript | postscript | superimposed coordinates (RasMol)

external links
PFAM : Xylose_isom  
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                           10        20        30        40        50  
1dxia  (   1 )    msfqptpedrFTFGLwTVgwqGrdpfgdatRpaldpveTVqrLaelgAyG
1xyaa  (   1 )     syqptpedrFTFGLwTVgwqGrdpfgdatRpaldpveTVqrLaelgAhG
6xia   (   1 )     nyqptpedrFTFGLwTVgweGrdpfgdatRtaLdpveSVrrLaelgAhG
1xima  (   3 )      vqAtredkFSFGLwTVgwqArdafgdatRtaLdpveAVhkLaeigAyG
4xiaa  (   2 )      vqptpadhFTFGLwTVgwtGadpfgvatRanLdpveAVhkLaelgAyG
1bxba  (   1 )     myepkpehrFTFGLwTVgnvgrdpfgdavrerldpvyVVhkLaeLgAyG
                        333 bbbbaaaa                 aaaaaaaaaaa   b

                           60        70        80        90        100 
1dxia  (  51 )    VTFhdddLipfgSsdtereshikrFrqAldatgMtVpMAtTnlfthpvFk
1xyaa  (  50 )    VTFhdddLipfgssdtereshikrFrqaldatgMtVpMATTnlfthpvFk
6xia   (  50 )    VTFhdddLIpfgssdseryehvkrFrqAlddtgMkVPMATTnlfthpvFk
1xima  (  51 )    ITFHdddLvpfgsdaqtrdgiiagFkkAldetgLiVpMVTTnlfthpvFk
4xiaa  (  50 )    ITFhdndLipfdAtaaerekilgdFnqAladtgLkVPMVTTnlfshpvFk
1bxba  (  50 )    VNLhdedLiprgtppaerdqiVrrFkkAldetgLkVPMVtAnlfsdpaFk
                  bbbbaaaa      aaaaaaaaaaaaaaaaaa     bbb      333 

                           110       120       130       140       150 
1dxia  ( 101 )    dGGfTAndrdvrryAlrkTigNIdLAaeLgAkTYVawgGrEGaesggakd
1xyaa  ( 100 )    dGGFTAndrdvrryAlrkTirNIdLAveLgAkTYVawgGrEGaesgaaKd
6xia   ( 100 )    dGGFTAndrdvrryAlrkTirNIdLAveLgAeTYVawgGrEGaesggaKd
1xima  ( 101 )    dGGFTSndrsvrryAirkVlrQMdLGaeLgAktLVlWgGrEGaeydsaKd
4xiaa  ( 100 )    dGGFTSndrsirrfAlakVlhNIdLAaeMgAeTFVmwgGrEGseydgsKd
1bxba  ( 100 )    dGAFTSpdpwvrayAlrKSleTMdLGaeLgAeIYVvwpGrEGaeveatgk
                          aaaaaaaaaaaaaaaaaaaa    bbbb     bb       

                           160       170       180       190       200 
1dxia  ( 151 )    vrdaldrmkeAFdlLGeyVtaqgydLrFAIEPKpneprgdIllptVghAl
1xyaa  ( 150 )    vrvAldrMkeAFdlLGeyVtsqgydTrFAIePKpneprgdIllptVghAl
6xia   ( 150 )    vrdAldrMkeAFdlLGeyVtsqgydIrFAIePKpneprgdIllptVghAl
1xima  ( 151 )    vsaAldrYreALnlLAqySedrgygLrFAIEPKpneprgdIllptAghAI
4xiaa  ( 150 )    laaaldrmregVdtAAgyIkdkgynLrIALEPKpneprgdIflptVghGl
1bxba  ( 150 )    arkVwdwvreaLnfMAayAedqgygYrFALePKpnepRgdIyFatVgsMl
                  aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa    bbbb         bb    aaaaa

                           210       220       230       240       250 
1dxia  ( 201 )    afIerLerpelYGVNPEvGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLFHIDLNGQs
1xyaa  ( 200 )    afIerLerpelYGVNPEVGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLfHIDLNGQs
6xia   ( 200 )    afIerLerpelYGVNPEvGHEqMaglnFphgIaqAlwagkLfHIDLNGQn
1xima  ( 201 )    afVqeLerpeLFGINPEtGHEqMsnlnFtqgIaqAlwhkkLfHIDLNGQh
4xiaa  ( 200 )    afIeqLehgdiVGLNPEtGHEqMaglnFthgIaqALwaekLFHIDLNGQr
1bxba  ( 200 )    aFIhtLdrperFGLNPEFAHETMaglnFvhaVaqAldagkLfHIDLNDQr
                  aaa     333bbb   aaaaa     aaaaaaaaaa       bb    

                           260       270       280       290       300 
1dxia  ( 251 )    gikydqDlrFGaGdlraaFwLVdlLeta------gyegPrHFdFkPprte
1xyaa  ( 250 )    gikyDqDlrFGaGdlraAFwLVdlLesa------gyegprHFDFkPprte
6xia   ( 250 )    gikydqdlrFGaGdlraaFwLVdlLesa------gysgPrHFdFkPprte
1xima  ( 251 )    gpkfdqDlvFGhGdllnaFsLVdlLEnG-pdgapaYdgpRHFDYkPsrte
4xiaa  ( 250 )    gikydqdlvFGhGdltsAFfTVDLLenGfpnggpkYtgPrHFdYkPsrtd
1bxba  ( 250 )    msrfdqdlrFGsenlkaAFfLVdlLess------gyqgPRHFdAhAlrte
                                aaaaaaaaaaaaa            bbb        

                           310       320       330       340       350 
1dxia  ( 295 )    dfdgVWasAagCMrnYlilkdrAaaFradpeVqealraAr--ldqlaqpt
1xyaa  ( 294 )    didgVWasAagCMrnYliLkerAaaFradpeVqealraSr--ldelaqpt
6xia   ( 294 )    dfdgVwasAagCMrnYliLkerAaaFradpeVqeAlraSr--ldelarpt
1xima  ( 300 )    dydgVwesAkaNirmYLlLkerAkafradpeVqeAlaaSk--vaelktpt
4xiaa  ( 300 )    gydgVwdsAkaNMsmYllLkerAlaFradpeVqeaMktSg--vfelgett
1bxba  ( 294 )    deegVWaFArgCMrtYliLkerAeaFredpeVkellaayyqedpaal--a
                   aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa  aaaaaaaaa            

                           360       370       380       390      
1dxia  ( 343 )    aad--gldalladraafedfdvdaaaargmafehldqLAmdhllgarg
1xyaa  ( 342 )    aad--gvqelladrtafedfdvdaaaargmaferldqlAmdHllgar 
6xia   ( 342 )    aad--glqallddrsafeefdvdaaaargmaferldqlAmdhLlgarg
1xima  ( 348 )    lnpgegyaelladrsafedydadavgakgfgfvklnqlaieHLlgar 
4xiaa  ( 348 )    lnagesaadlmndsasfagfdaeaaaernfafirlnqLAieHLlgsr 
1bxba  ( 342 )    llgpysrekaealkra--elpleakrrrgyalerldqlAveYllgvrg
                         aaaa          aaaaa     aaaaaaaaaaaa     


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